Vers une surveillance de la biodiversité à grande échelle en Europe

Nommé en hommage au célèbre navire qui a transporté Charles Darwin, le projet BEAGLE (Biodiversity Methods for Advanced Monitoring at Large Scales) est une initiative européenne majeure.

Son ambition ? Générer jusqu’à un milliard de nouvelles données sur la biodiversité à travers les écosystèmes terrestres, marins et d’eau douce de l’Union Européenne.

Aujourd’hui, le suivi de la biodiversité en Europe est encore trop fragmenté. Pour évaluer l’efficacité des politiques de restauration de la nature (comme le Pacte vert pour l’Europe ou la loi sur la restauration de la nature), les scientifiques et les décideurs ont besoin de données massives, précises et standardisées. BEAGLE répond à ce défi en combinant des technologies de pointe : capteurs automatisés, ADN environnemental (ADNe), intelligence artificielle et sciences participatives.

Pourquoi BEAGLE est-il un projet clé pour Pl@ntNet ?

En tant que membre central du consortium BEAGLE, l’écosystème Pl@ntNet sera au cœur de plusieurs innovations technologiques majeures qui bénéficieront directement à ses utilisateurs et à la recherche :

De l’espèce à l’habitat avec GeoPl@ntNet : Le projet permettra d’étendre les capacités de Pl@ntNet au-delà de la simple identification d’espèces. Le projet développera GeoPl@ntNet, une application web et une base de données capables de cartographier la structure et la condition des habitats à haute résolution, en croisant les observations citoyennes avec des données satellites et d’apprentissage profond (deep learning).

Une Intelligence Artificielle « Nouvelle Génération » : Les modèles d’IA de Pl@ntNet seront perfectionnés pour analyser des scènes complexes (classification multi-labels) et estimer la couverture végétale. L’objectif est de traiter d’immenses volumes de données tout en quantifiant le degré d’incertitude des prédictions.

La synergie des observateurs citoyens : BEAGLE vise à harmoniser et dynamiser les plateformes de sciences participatives en Europe (comme Pl@ntNet et MINKA). Des campagnes ciblées seront organisées dans les pays sous-représentés et des outils de ludification (badges, classements) seront testés pour encourager l’engagement à long terme des contributeurs.

Les 4 grands objectifs du projet BEAGLE

Pour transformer la manière dont l’Europe observe sa nature, le projet s’articule autour de quatre objectifs complémentaires couvrant toute la chaîne de valeur, de la collecte sur le terrain jusqu’à la décision politique.

BEAGLE va commencer par identifier les lacunes spatiales, temporelles et taxonomiques dans les données actuelles. Le projet déploiera stratégiquement de nouveaux capteurs et mobilisera les données existantes mais inaccessibles, afin d’avoir une représentation fidèle des différents climats et écosystèmes européens.

Le projet s’appuie sur une combinaison de trois méthodes :

. Capteurs automatisés : Déploiement massif de pièges photographiques, d’enregistreurs acoustiques autonomes, de drones et de caméras embarquées.

. Échantillonnage biologique : Utilisation de l’ADN environnemental (analyse des traces d’ADN laissées dans l’eau ou le sol) via des pipelines bioinformatiques avancés.

. Sciences participatives : Mobilisation des citoyens via Pl@ntNet pour couvrir de vastes zones géographiques de manière rentable et inclusive.

Toutes les données brutes seront standardisées (notamment via le format Darwin Core Humboldt Extension). Elles permettront de créer des cartes haute résolution de la distribution des espèces et de la qualité des habitats. L’objectif final est de transformer ces données en connaissances exploitables.

Une démarche fondée sur la Science Ouverte (Open Science)

Dans un souci de transparence et de durabilité, BEAGLE applique strictement les principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, and Reusable). Les millions d’observations générées, y compris celles issues de la communauté Pl@ntNet, seront partagées librement, contribuant ainsi de manière durable à la protection de la biodiversité mondiale.

CORDIS: https://cordis.europa.eu/project/id/101288886